Slipknot's 'Custer' is een diepgeworteld en agressief nummer dat het kenmerkende geluid en de thematische inhoud van de band omvat. De titel van het nummer zelf is een waarschijnlijke verwijzing naar generaal George Armstrong Custer, bekend om zijn laatste standpunt in de Slag bij Little Bighorn, wat een uitdagende houding tegen een overweldigende overmacht zou kunnen symboliseren. De teksten brengen een gevoel van frustratie en rebellie over tegen maatschappelijke normen en de onderdrukking van individualiteit. De openingsregels zetten de toon voor een ontwrichtende boodschap, waarin luisteraars werden gewaarschuwd voor de intense aard van de inhoud van het nummer.
Het refrein van het lied, met het herhaalde gebruik van godslastering en de zinsnede 'cut me up and fuck me up', suggereert een zelfdestructieve reactie op de druk en kritiek vanuit de samenleving. Dit zou geïnterpreteerd kunnen worden als een metafoor voor de manier waarop de kunstenaar denkt dat de samenleving probeert individuen te kneden, hun uniciteit weg te snijden en hun gevoel van eigenwaarde te 'verpesten'. De verzen verdiepen zich in thema's als middelmatigheid, conformiteit en de strijd om verpletterd te worden door 'gewone mensen' met hun 'jaloezie en onwetendheid'. Het lied weerspiegelt een minachting voor het alledaagse en een verlangen om los te komen van de beperkingen van wat als normaal of acceptabel wordt beschouwd.
Het lied gaat ook over het idee van het begrijpen van iemands strijd en het vechten tegen angst en de hel, wat een metafoor zou kunnen zijn voor persoonlijke demonen of maatschappelijke uitdagingen. De vermelding van 'androgynie en beledigingen' en de strijd om 'moeilijk' te zijn zou een antwoord kunnen zijn op de kritiek waarmee de band, en in bredere zin, niet-conforme individuen, te maken krijgen als ze traditionele normen uitdagen. 'Custer' is een strijdkreet voor degenen die zich gemarginaliseerd en onbegrepen voelen, en moedigt weerstand aan en de omhelzing van het ware zelf, ondanks de onvermijdelijke terugslag.